將藍隧道及將軍澳跨灣連接路上月啟用，九巴表示，來往將軍澳至科學園的96線上座率最高，正向運輸署申請加強服務，包括延長服務時間及加開特快班次，另外亦正研究過海巴士服務。

將藍隧道啟用後，九巴共新增3條將藍公路巴士路線，只在周一至周五上午及下午繁忙時段提供服務，分別往來將軍澳至九龍或新界等地區，暫時無過海路線。九巴表示，由日出康城往東隧只需約5至7分鐘，正非常積極研究日出康城前往港島，包括灣仔及中西區一帶的巴士服務，希望跟運輸署在數月內達成共識。

九巴表示，將藍隧道啟用後，有效舒緩區內塞車情況，疏導將軍澳隧道的車流量。九巴因交通擠塞向內部車務人員發出的黃色警報，在道路啟用前一個月有28次，而在通車後只有因天雨行車緩慢發出過一次，亦令車龍縮短，途經將軍澳隧道路線的車程縮短8至10分鐘。

九巴又表示，正分階段更新手機應用程式介面，乘客稍後可以一站式查詢不同轉車站的轉乘路線和相關優惠。