曾經因為「基因編輯人類胚胎」事件在內地被判監3年的內地科學家賀建奎，透過「高端人才通行證計劃」獲批來港。政府發言人深夜回應事件表示，懷疑有人作出虛假陳述，入境處處長已宣告賀建奎的簽證無效。入境處即日起要求高才通計劃申請人必須申報是否有刑事定罪紀錄。

中大工程學院副院長、立法會議員黃錦輝在本台節目《千禧年代》說，不應容許行為不良好的人來港，認為當局起初無詢問有無刑事紀錄是不足，但形容政府事後反應快，即時改變過來。黃錦輝說最有效是在源頭堵截，認為如果有關人士有意願作相關申請，當局應要求對方出示良民證。他相信以賀建奎的個案，有關當局未必向他發出良民證。對於已批出的高才通個案，他說可待有關人士日後找工作時調查其相關紀錄。

黃錦輝認為高才通計劃獲批人士不應有案底，以他學校為例子，一般不會聘請有案底人士。他又說當局應進一步交代賀建奎是循哪個高才通計劃類別申請而本來獲批。

根據政府高才通計劃資料，其中一個申請途徑是獲全球百強大學頒授學士學位、並在緊接申請前5年內累積至少3年工作經驗的人士。黃錦輝分析指賀建奎被監禁3年，去年4月獲釋，認為事件涉及有關人士申報中，有否虛報在相關年期內累積足夠經驗。

民建聯立法會議員黃俊碩在同一節目說高才通計劃原意是好，當局為搶人才而簡化機制，在出現今次情況後已有補救措施。黃俊碩說有個案短時間內獲批，認為當局要加強抽查，建議可採用有如稅務機制的「先批後核」方式，以防機制被濫用。

對於有報道指有人計劃透過高通才計劃來港產子。黃俊碩說，計劃屬人才政策，如果有人來港目的只是為生仔，是違反政策原意。