政府公布的三隧分流方案，將分兩階段實施，首階段在今年8月2日，收回西隧當日起實施「633固定收費方案」，屆時私家車行西隧，收取60元，較現時減15元，紅隧及東隧就劃一收30元，分別較現時加10元和5元。的士經這三條隧道，全日劃一收25元，乘客過海要付出來回隧道費，即50元。

到了第二階段，會實施「不同時段，不同收費」方案，未有明確實施日期，目標在今年內實施，屆時影響的主要是私家車和電單車兩類載客率低的車種，方案分為三個不同時段作不同收費。以私家車為例，早上7時半至10時15分，及傍晚4時半至7時的繁忙時間，西隧收費60元，紅隧及東隧劃一收40元。

至於兩個時段中間的6小時屬於「一般時段」，三條隧道劃一收30元，餘下的12小時「非繁忙時段」則最平，劃一收20元。電單車收費將是私家車的4成，即8元至24元。的士收費全日維持在25元水平。

周日及公眾假期只會分一般和非繁忙兩個時段，分別收25和20元。