香港大學發生校政風波，政府罕有成立調研小組跟進大學內部運作事宜，教育局局長蔡若蓮表示，行政長官對港大非常關心和愛護，調研小組的工作務實，不會等幾個月或半年後才提交報告，而是一有進展就會向行政長官匯報。

蔡若蓮接受本台《上任兩周年》系列專訪時形容，調查小組工作是互動過程，會釐清事實，與各方溝通協調，以及向院校提出良好措施及建議。她又說，八間資助大學每年獲政府投放200多億元資源，大學是屬於香港，不是屬於某一個會或某一個人，不會因為擔心影響面子而不去處理問題。

被問到是否認同全國僑聯前副主席盧文端撰文指，不配合調研小組即是和特區政府對著幹。蔡若蓮重申任何人都可以自由表達意見，她希望各方以大學利益為依歸，以學生福祉為最優先考慮。

中大及港大先後發生管治風波，蔡若蓮不擔心海外學者會因而對來港發展卻步，從而阻礙本港成為國際高等教育樞紐。她指出，院校紛爭並非香港獨有，而是全世界的大學都在面對，近日亦有美國知名大學校長要辭職，相信本港的高等教育優秀，可以克服問題。