保安局局長鄧炳強表示，特區政府得悉深圳即將為羅湖口岸實施改造工作，深圳方面無計劃將港鐵東鐵綫引入深圳羅湖區，並沿用目前的清關模式，不會使用「合作查驗、一次放行」。

有立法會議員認為，要提高過關效率，通關模式只是其中一個方法，亦可透過科技協助；亦有議員指，羅湖口岸中長期或會另覓地方重建，現階段不能排除相關通關模式，將來仍會在口岸實施。