佔地約32公頃的落馬洲濕地，自從2007年起由港鐵公司管理，目前有超過280多種鳥類出沒，比2007年上升約25%，亦有蜻蜓、爬行類、哺乳類及兩棲類等物種到訪，港鐵早前與港大合作試驗可持續管理濕地的新措施。

新措施包括建立「濕地植物及魚苗培育基地」，有9個獨立水缸培育金沙鯽，魚苗長大後可作為雀鳥食糧。魚塘亦設置3款組合式的生態浮島，種植農作物及水生植物，包括國家二級保護植物水蕨，同時設立竹製蚌排，引入淡水蚌，利用其去除雜質的特性，以自然方式調節水質。公眾參與方面，去年有5間中學、50多位學生獲邀參與水生植物苗圃試驗計劃，加強對濕地保育的認識，並正邀請其他團體參觀濕地，試驗有限度開放的可行性。

有份參與計劃的港大公民社會與治理研究中心總監林維峯說，落馬洲濕地潛力很大，可透過引入新思維管理濕地。港鐵車務工程服務及創科總管陳慶強說，措施初見成效，今年完成測試後，會再制定長遠方案。他又強調，在推進每個鐵路項目包括北環綫時，有與不同持份者溝通，盡量減低對環境的影響。